Постановлением Правительства Кыргызской Республики в 1951 году, когда образован Ошский Педагогический институт(нынешний ОшГУ), в составе учебного заведения также был образован факультет физики и математики. В основании и укреплении факультета и кафедры огромный вклад внесли кандидаты физико-математических наук, доценты Ф.И.Половиков и Шамгуновы.
Кафедра экспериментальной и теоретической физики была основана в 1965 году. Со дня основания и до 1985 года кафедрой руководили доцент Заитов Ф.Н., с 1986года по 1991 год доцент Эгембердиев Ж.,с 1991года по 1998год профессор Б.Арапов, с 1998 года по 2007 год доцент А.Усаров.С сентября 2007 года по настоящего время руководит заслуженный научный деятель КР,член-корр.Российской Академии Естествознания,д.ф.-м.н., профессор Б.Арапов